主要讲甲状腺结节，许多桥本氏症患者都有结节，因为甲状腺结节的根本原因，通常与自身自身免疫性疾病的根本原因相同，包括：
→甲状腺慢性炎症（甲状腺炎）
与自身免疫性相关的的慢性炎症，会增加甲状腺结节的风险，还能进一步扩大结节。
对于桥本氏症，身体会对甲状腺产生的正常蛋白质，产生抗体，这反过来又会导致恶性结节的发展。
→碘、硒和维生素D的缺乏
碘缺乏通常发生在缺碘地区人群中，并可能导致多结节性甲状腺肿。
对于桥本氏症，碘过量也有可能产生结节。
维生素D缺乏症很常见，它能够控制细胞生长和分裂，如果缺乏的话，会增加身体许多部位结节、纤维化和息肉的风险。
缺硒也是结节的潜在原因，有研究表明，补充硒可以改善甲状腺超声特征，和缩小结节。
→毒素感染
这一因素常常被人们所忽略，2015年的一项研究发现，居住在石化综合体附近的人，因此会受到污染，出现甲状腺结节的频率更高。
有研究显示，辐射暴露，毒暴露，如镍毒性，可能在桥本氏症患者结节的发展中发挥作用。
→怀孕和荷尔蒙变化
有些女性在怀孕期间，会出现甲状腺结节，并且预先存在的甲状腺结节，可能会在怀孕期间生长。
一项研究发现，在怀孕的每个3个月间隔，甲状腺结节的数量和大小都有所增加；结节的生长，似乎比非孕妇要快得多。
怀孕期间出现结节的原因尚不清楚，但研究表明，这可能是由于与怀孕相关的负碘平衡。
→幽门螺杆菌感染
幽门螺杆菌感染也被认为是桥本氏症的触发因素，在一项研究中，近50%的桥本氏症患者，发现了这种感染。
2013年的一项研究发现，幽门螺杆菌感染与个体甲状腺结节的存在有关，尽管甲状腺功能正常。
分子模拟理论表明，当免疫系统感染，与甲状腺成分相似的致病生物时，免疫系统可能会攻击自己的甲状腺。
因此，幽门螺杆菌感染，也可能会增加对甲状腺的自身免疫攻击，导致甲状腺结节的发展。
→食物和饮食
食物敏感性会加剧对甲状腺的攻击，增加慢性炎症的水平，而慢性炎症与结节的发育和扩大有关。
所以，要排除让自己过敏的食物，通过排除法找出来。
此外，血糖失衡也会导致甲状腺结节的风险增加。
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