咳嗽是继疲劳之后，新冠感染的第二常见持续症状。许多疾病都可以引起咳嗽，病毒感染后引起的咳嗽称为病毒感染后咳嗽。如果咳嗽持续时间超过3周，则称为病毒后咳嗽综合征（PVCS）。
阳后持续咳嗽有以下几种可能：
第一，主要原因为病毒引起的炎症反应。新冠病毒会使气道的粘膜发炎，从喉咙开始并深入支气管，气道炎症会引起咳嗽，而咳嗽又会加重炎症，这个循环是咳嗽的原因之一。另外，奥密克戎在气道中的繁殖速度比德尔塔和原始株快70倍，据报道，奥密克戎感染者中约83%有咳嗽症状。
即使“转阴”后，这种炎症仍可以存在，“残留炎症”是持续性咳嗽的原因之一。
不过，咳嗽也不一定是坏事，在疾病早期，咳嗽反射能够帮助患者排出“免疫大战”第一线的坏死组织，保持呼吸道畅通，这种保护性咳嗽反射恢复所必须的。
第二，感觉神经源性咳嗽（SNC）。新冠病毒具有嗜神经性，更容易导致感觉神经病理和炎症方面的改变，从而引起刺激性咳嗽。当病毒损伤或致敏了气管、喉部或喉咙的感觉神经末梢，这些受刺激的神经末梢会不停地要求你咳嗽。
第三，鼻后滴漏综合征及咳嗽变异性哮喘是慢性咳嗽的常见原因，如果合并新冠感染可能加重咳嗽症状。
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