大多数人都是关注阴道细菌和真菌是如何导致这些疾病的。有一部分人会自行买来洗液清洗，孰不知长期用洗液清洗，会杀死对身体有益的菌群，使局部抵抗能力下降，反而增加感染几率。抗生素和抗真菌药物并不总是有效，因为细菌和真菌可以形成生物膜来抵抗治疗或自然获得耐药性。抗生素也可能影响阴道乳酸杆菌，增加细菌性阴道炎和念珠菌病的复发。
其实，我们应该关注阴道菌群的平衡。健康阴道的标志之一是细菌多样性有限，而阴道乳酸杆菌丰度高。高水平的阴道乳酸杆菌与阴道健康密切相关。乳酸杆菌在与宿主的先天免疫系统相互作用中发挥着重要作用，缺乏乳酸杆菌会增加多种阴道感染的风险。乳酸杆菌产生的乳酸，会提供一个酸性微环境，防止潜在的有害细菌过度生长。
我们应该寻求更有效和自然的方法来平衡阴道菌群和维持健康的阴道环境。乳酸杆菌是一种经过充分研究的益生菌，可用于维持健康的阴道菌群或者在抗生素治疗后恢复正常的阴道菌群。事实上，越来越多的证据表明，益生菌的使用对细菌性阴道炎和阴道念珠菌病的治疗有益，它们可以促进女性一生的健康。
阴道菌群
与其它动物，特别是非人灵长类动物相比，人类阴道菌群的组成相对不同。例如，乳酸杆菌通常占人类阴道菌群的70%左右，而乳酸杆菌仅占其它哺乳动物阴道菌群组成的一小部分。因此，其它哺乳动物阴道分泌液的pH值更接近中性。
人类阴道菌群可以分为5种不同的群落类型，其中CSTI、II、III、V型分别以卷曲乳杆菌、格氏乳杆菌、惰性乳杆菌、詹氏乳杆菌占优势，而CSTIV型缺乏乳酸杆菌，主要由大量的厌氧菌组成，包括普氏菌、斯尼思氏梭杆菌、戴阿利斯特菌、爱格士氏菌、陌生菌、气球菌、加德纳氏菌、芬沟德氏菌、巨球形菌、动弯杆菌和嗜蛋白胨菌等。CSTIV型又可以分为两个亚群：CSTIV-A（包含惰性乳杆菌和严格厌氧菌），CSTIV-B（包含细菌性阴道炎相关细菌物种，主要是梭菌目细菌）。
CSTI、II和V型最常与健康相关，IV型在临床上可能表现为细菌性阴道炎或需氧菌型阴道炎，III型与健康和菌群失调有关，并经常与细菌性阴道炎有关。
与细菌相比，真菌的作用和影响远没有那么为人所知。尽管真菌在维持人体内稳态和免疫防御方面具有重要作用，但人们对真菌在健康阴道中的作用知之甚少。阴道真菌群是指寄生于女性生殖系统下部的真菌群落，包括酵母和丝状真菌。子囊菌和担子菌是阴道最常见的真菌。念珠菌、枝孢菌、毕赤酵母、曲霉菌和红酵母是泌尿生殖道中最常见的真菌。生态失调引起的细菌种群变化也会增加真菌生长和机会性感染的机会。
白色念珠菌、都柏林念珠菌、光滑念珠菌、克鲁斯假丝酵母、近平滑念珠菌和热带念珠菌是阴道真菌群中最常见的念珠菌种类。目前研究较多的是白色念珠菌，这是阴道真菌群中最著名的成员。阴道念珠菌病是由机会性感染引起的。据观察，白色念珠菌是无症状非孕妇中最常见的真菌种类，占20%。
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