急性肠系膜淋巴结炎的核心病因是感染诱发的免疫反应，其中病毒感染最为常见，少数由细菌感染或其他因素引发。
主要病因：感染因素
病毒感染是首要原因，占比约 70%-80%，常见病毒包括柯萨奇病毒、腺病毒、EB 病毒、流感及副流感病毒等。
细菌感染较为少见，多为继发感染，常见致病菌有链球菌、大肠杆菌、沙门氏菌等。
诱发机制
感染后，病原体及其代谢产物通过血液或淋巴系统扩散至肠系膜淋巴结。
淋巴结作为免疫器官，会因抵抗感染而出现充血、水肿、增生，进而引发炎症反应，压迫周围组织导致腹痛等症状。
常见诱发场景
先有上呼吸道感染，如感冒、扁桃体炎、咽炎等，后续出现肠系膜淋巴结炎。
肠道感染后诱发，如肠炎、痢疾等，病原体直接刺激肠道相关的肠系膜淋巴结。
受凉、劳累、免疫力下降时，身体对感染的抵抗力减弱，更易诱发该病。