急性肠系膜淋巴结炎的并发症并不常见，多数患者经保守治疗后可痊愈，少数情况下可能出现肠梗阻、肠穿孔等严重情况。
常见并发症
肠梗阻：肠系膜淋巴结严重肿大时，可能压迫肠道或导致肠管痉挛，引发不完全性或完全性肠梗阻。表现为腹痛加剧、呕吐频繁、停止排便排气、腹部膨隆。
肠穿孔：极少数严重炎症可能累及肠壁，或因肠道缺血坏死，导致肠穿孔。表现为突发剧烈腹痛、全腹压痛反跳痛、发热加重，甚至出现休克。
少见并发症
感染扩散：细菌感染未及时控制时，可能引发败血症、化脓性肠系膜淋巴结炎，表现为高热不退、寒战、精神萎靡。
慢性肠系膜淋巴结炎：部分患者病情反复，可能转为慢性，出现长期反复的腹痛、消化不良。